隱孢子蟲（Cryptosporidium）、十二指腸賈第鞭毛蟲（Giardia duodenalis）和畢氏腸微孢子蟲（Enterocytozoon bieneusi）是引起人類腹瀉的三種常見腸道原蟲。這些腸道原蟲主要經(jīng)糞口途徑傳播，人通過攝入被污染的水而感染。污水流行病學(xué)（Wastewater-based epidemiology，WBE）是一種監(jiān)測污水中腸道病原體污染水平的方法，可用于評估流域內(nèi)水源性傳播疾病的流行情況和趨勢。目前，對上海市隱孢子蟲、十二指腸賈第鞭毛蟲和畢氏腸微孢子蟲的人類流行病學(xué)調(diào)查僅限于兒童、腹瀉患者、HIV/AIDS患者等少數(shù)人群，每種病原體在當(dāng)?shù)厝巳褐械母腥拘陨胁淮_定。本研究基于污水流行病學(xué)的方法，從上海市楊浦區(qū)污水處理廠收集了進出水共48個城市污水樣本，通過巢式PCR擴增結(jié)合測序的方法，對三種病原體進行了檢測和分型，并在基因型和亞型水平上評估可能的感染源。隱孢子蟲、十二指腸賈第鞭毛蟲和畢氏腸微孢子蟲的檢出率分別為4.2%（2/48）、25.0%（12/48）和2.1%（1/48）。進水和出水中均檢出了隱孢子蟲和十二指腸賈第鞭毛蟲，其中隱孢子蟲的檢出率分別為4.2%（1/24）和4.2%（1/24），十二指腸賈第鞭毛蟲的檢出率分別為33.3%（8/24）和16.7%（4/24），畢氏腸微孢子蟲僅在1個出水樣品中檢出（4.2%，1/24）。本研究檢測到的人隱孢子蟲，進一步鑒定為IdA14亞型，在12個樣本中檢測到十二指腸賈第鞭毛蟲集聚體AⅡ（n=8）和集聚體C（n=4），1個樣本中檢測到畢氏腸微孢子蟲基因型A。污水處理廠進出水三種腸道病原體的發(fā)現(xiàn)表明當(dāng)?shù)厝巳嚎赡馨l(fā)生了人際傳播，這與該地區(qū)既往針對這些病原體的流行病學(xué)研究結(jié)果一致。此外，研究結(jié)果也進一步提示W(wǎng)BE可以作為一種有效的流行病監(jiān)測工具，能夠更好地了解人群中病原體的流行情況和遺傳特征。因此，有必要加強污水的處理并對污水中的病原體定期開展監(jiān)測，降低環(huán)境污染和居民感染的風(fēng)險。
本文已于2024年9月24日在線發(fā)表于國際學(xué)術(shù)期刊Microbiology Spectrum上。
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